Pour Daniil Boiko et Andrei Tyrin, l’idée de Onepot AI est née de la même frustration.
« Les meilleures idées en matière de découverte de médicaments étaient souvent bloquées non pas par la biologie, mais par la synthèse », a déclaré Boiko à TechCrunch. La synthèse est la création de nouvelles molécules en utilisant des réactions chimiques. C’est comme une recette ou des pièces de Lego, où de petits morceaux, ingrédients, molécules s’assemblent pour former une image de puzzle plus large, un plat de nourriture, une molécule plus grosse.
Comme on pouvait s’y attendre, il est assez difficile de créer ces petites molécules qui en construisent de plus grosses.
Pour Boiko, un doctorat. candidat étudiant l’apprentissage automatique en chimie à Carnegie Mellon (il a obtenu sa licence et sa maîtrise en chimie organique dans une université en Russie), cela signifiait se rendre compte que les chasseurs de médicaments – les scientifiques qui supervisent la découverte et le développement de médicaments – ignoraient des idées prometteuses simplement parce que les molécules chimiques nécessaires à la création des médicaments semblaient trop difficiles à fabriquer.
« Les composés n’ont même jamais eu la chance d’être testés », a déclaré Boiko à TechCrunch.
Pour Tyrin (qui a obtenu son baccalauréat en informatique au MIT), son temps de travail sur les pipelines informatiques de découverte de médicaments lui a fait réaliser à quel point le monde de la découverte de médicaments était en retard. « Les modèles pourraient générer des idées en quelques heures, mais le laboratoire pourrait mettre des mois à rattraper son retard », a-t-il déclaré à TechCrunch.
« Nous avons tous deux constaté que le monde investissait de l’argent dans la conception moléculaire et ignorait presque le problème plus difficile de la fabrication des molécules », a déclaré Boiko. Mais il y a aussi un aspect géopolitique, a-t-il poursuivi : les chaînes d’approvisionnement mondiales deviennent vulnérables et les États-Unis entrent une fois de plus dans une guerre commerciale et une concurrence innovante avec la Chine.
Événement Techcrunch
San Francisco
|
13-15 octobre 2026
« C’était clair », a déclaré Boiko. « La synthèse moléculaire à petite échelle devait être reconstruite à partir de zéro aux États-Unis. »
Boiko et Tyrin se sont réunis pour créer Onepot, une entreprise qui abrite le laboratoire de synthèse de petites molécules POT-1. Ils ont également créé Phil, un chimiste organique en IA, pour aider à effectuer des analyses expérimentales afin d’augmenter le processus de synthèse de composés pour leurs premiers partenaires commerciaux. Ces partenaires sont des sociétés biotechnologiques et pharmaceutiques qui testent actuellement leur technologie.
Mercredi, la société est sortie furtivement avec un financement de 13 millions de dollars, y compris un capital de pré-amorçage, et un tour de table mené par Fifty Years.
« Actuellement, les sociétés pharmaceutiques et biotechnologiques constituent des équipes entières de chimistes en interne ou travaillent avec des organismes de recherche sous contrat à l’étranger », a déclaré Tryin à propos du processus de synthèse moléculaire. Les chimistes humains peuvent consacrer des mois de recherche pour créer ne serait-ce qu’un seul composé, pour un coût de plusieurs millions de dollars.
Cela implique de nombreux essais et erreurs : étudier la collecte de divers composés, les données sur l’activité biologique, la façon dont le médicament se déplace dans le corps, les rapports toxicologiques et trouver ce qu’il faut expérimenter ensuite. « Le principal facteur limitant ici n’est pas de tester ces composés, mais de les fabriquer en premier lieu », a poursuivi Tyrin. « Nous visons à réduire cela à quelques jours. »
Tyrin a déclaré que le produit était assez simple. Onepot dispose d’un catalogue de molécules qu’il peut fabriquer. Les clients choisissent les composés qu’ils souhaitent, puis la technologie Onepot synthétisera les molécules puis les expédiera au client afin que celui-ci puisse les utiliser dans ses propres expériences. (Ils expédient des produits physiques sous forme de composés secs de solutions dans des plaques ou des flacons).
C’est dans le backend du produit que Boiko et Tyrin s’amusent, disséquant les problèmes de synthèse chimique pour découvrir quelles combinaisons de molécules fonctionnent ensemble. Ils ont construit un laboratoire dans lequel ils permettent aux agents LLM d’accéder à ces soi-disant recettes moléculaires pour la formation afin que les agents puissent également découvrir ce qui fonctionne et ce qui ne fonctionne pas dans la construction d’un complexe.
« Lors de l’exécution d’expériences en laboratoire, nous capturons chaque détail du processus », a déclaré Tyrin. Cela signifie suivre la température et, essentiellement, les ingrédients qui ont été ajoutés à un mélange pour créer des composés. « Aucune information n’est perdue, ce qui rend les expériences reproductibles même si quelqu’un décide de les répéter dans dix ans. »
Cela signifie également que leurs agents génèrent des hypothèses à partir d’expériences réelles plutôt que de données documentaires, souvent extraites d’Internet.
Boiko a qualifié le processus de collecte de fonds de « mouvementé » et a déclaré avoir soumis son investisseur principal à une introduction. « Ce qui était censé être une courte réunion s’est transformé en une séance de plusieurs heures sur tableau blanc sur l’industrialisation de la synthèse », a déclaré Boiko. Parmi les autres participants figurent Khosla Ventures, Speedinvest, le co-fondateur d’OpenAI Wojciech Zaremba et le scientifique en chef de Google, Jeff Dean.
Le nouveau capital servira à construire un deuxième laboratoire à San Francisco afin que l’équipe puisse accueillir davantage de clients. Cela élargira également l’équipe et son moteur de découverte de composés. Du côté des services, Boiko et Tyrin considèrent WuXi AppTec et Enamine comme des concurrents.
Dans l’ensemble, Boiko et Tyrin espèrent rendre la découverte de médicaments au moins deux fois plus rapide et, espérons-le, changer la perception de ce qui est possible après avoir exploité la chimie « étrange » que les scientifiques pensaient autrefois interdite.
« Vous n’accélérez pas seulement la découverte de médicaments, vous élargissez l’espace de conception pour ce que peuvent être les médicaments et les matériaux », a déclaré Boiko. « Ce médicament que nous n’avons pas encore découvert pourrait être là, attendant que nous le trouvions. »
